4月1日，南斯拉夫前总统米洛舍维奇的亲信伊夫科维奇证实，警方己经逮捕米洛舍维奇，并把他送往一个秘密地点，结束了26小时的对峙僵局。当天凌晨5时塞尔维亚政府也证实，塞尔维亚警方已经逮捕了南联盟前总统米洛舍维奇。
据悉，米洛舍维奇目前被关押在贝尔格莱德中心监狱。他将于当日开始接受法庭调查。除原有的诉讼，法庭还将追究其在31日晨拒捕并造成多人受伤的责任。
3月31日，塞尔维亚共和国内务部长米哈伊洛维奇宣布，有关方面已对米洛舍维奇“以滥用职权等罪行”提出起诉，并决定对他实行逮捕。塞尔维亚警方3月31日凌晨曾试图进入米洛舍维奇的住所逮捕他，但遭到了米洛舍维奇支持者的反抗，双方发生了枪战，数名警察被打伤。
去年南联盟总统选举后，以美国为首的西方国家和海牙国际法庭一再要求引渡米洛舍维奇去海牙接受审判。自今年以来，西方尤其是美国就逮捕米洛舍维奇问题不断向南联盟政府施压。2月22日，美国民主党参议员利伯曼公开扬言，美国对南斯拉夫的下一笔数额为1亿美元的经济援助将直接取决于贝尔格莱德与海牙国际法庭的合作程度。
3月10日，《纽约时报》援引一位美国官员的话说：“如果南联盟在3月31日之前不能就此和海牙法庭达成协议，那么南联盟不但面临着失去1亿美元的经济援助的危险，而且美国还将阻止世行和国际货币基金组织向南联盟提供援助！”
自2月起，前南国际战犯法庭频频派员前往南联盟搜集米洛舍维奇的各种指控证据；3月初，前南国际战犯法庭表示会对米洛舍维奇提起新的指控，那就是除1999年对科索沃战争的指控之外，米洛舍维奇将第一次被控对克罗地亚和波斯尼亚的战争罪行负责。
不堪重负的南联盟政府终于一步一步地向米洛舍维奇紧逼过来。
2001年1月29日，根据南联盟检察院的决定，从内务部抽调几十名武装警卫守卫米洛舍维奇，以取代南联盟国家安全部门的40名保卫军官，取消米洛舍维奇的“奔驰”专车使用权利，撤走10名家庭服务员。
2月13日，南联盟总统科什图尼察透露说，南联盟正在制定新法律，这部新法律将取消对引渡南联盟公民的限制。据分析，这为逮捕引渡米洛舍维奇扫清了法律障碍。同一天，塞尔维亚议会还通过了一项新的决议，取消米洛舍维奇的护卫队，只留一人保护米洛舍维奇的安全。
3月2日，南联盟总统科什图尼察表示，他无权阻止米洛舍维奇被引渡到海牙联合国前南战犯法庭受审。
3月15日，南联盟驻联合国大使米兰·普罗蒂奇公开宣称，他相信米洛舍维奇将在3月31日前被捕。此前，普罗蒂奇曾在美国国会说，米洛舍维奇将在3月底之前被捕。
3月30日，南斯拉夫当局已下达命令，对米洛舍维奇的住所断水、断电，胁迫米氏尽早投降，束手就擒。
美国政府对南联盟逮捕米洛舍维奇一事表示非常欢迎。一位美国官员表示，“我们已被告知米洛舍维奇已在逮捕之中。”他同时称，白宫将很快就此事发表一份声明。美国总统布什表示，美国正在密切注视着南联盟政府的举动和事态的发展。他称，“我们在非常仔细地关注着此事，我们愿意以任何方式进行协助，只要他们提出请求。”小布什还称，他已经就此事与国务卿鲍威尔进行了磋商。鲍威尔称，“未来两天内事态的发展将表明南联盟政府的立场，而这也将决定美国政府的立场。”
据南通社援引塞尔维亚社会党30日发表的声明说，北约开始轰炸南联盟两周年之际，在柏林召开的第一届欧洲和平论坛上，一批来自欧洲各国的政治家、议员、科学家和作家组成了“保卫米洛舍维奇国际委员会”。该委员会发表声明指出，海牙国际法庭对米洛舍维奇的指控毫无根据，米洛舍维奇捍卫了南联盟的国家主权，维护了南联盟人民的自由和尊严。
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